Productions


Septentrion Environnement croit fortement à l’importance du partage du savoir. Engagés dans une démarche de Science Ouverte, la majorité de nos ouvrages sont publiés sous licence Creative Common BY 4.0 : ils peuvent être téléchargés, partagés et adaptés librement, sous condition de citer l’ouvrage original.

2021

Vidéos

POLARIS – Tutoriel Protocole Coral Alert

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Un tutoriel pour apprendre à appliquer le protocole de Science Participative « Coral Alert! », afin de détecter les effets du réchauffement des eaux sur les coraux et les gorgonaires.

2021

Vidéos

POLARIS – Tutoriel Protocole Fish Visual Census

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Un tutoriel pour apprendre à appliquer le protocole de Science Participative « Fish Visual Census »: identification et comptage d’espèces de poissons cibles.

Septentrion-environnement

2021

Publications scientifiques et ouvrages

The three-dimensional structure of Mediterranean shallow rocky reefs: use of photogrammetry-based descriptors to assess its influence on associated teleost assemblages

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In the Mediterranean Sea, shallow rocky reefs and the associated three-dimensional (3D) structure support rich and abundant communities; they are therefore of functional importance, in particular for the renewal of fish stocks. However, these habitats and their functions are likely to be altered by anthropogenic pressures inducing habitat transformations. It is therefore necessary to assess their 3D structure, their transformations and relationship to communities, especially for management and conservation purposes. In this article we aimed (i) to compare two methods that quantify the metrics of the 3D structure (rugosity) of shallow rocky reefs (chain-and-tape method and photogrammetry), and (ii) to quantify the possible links between this habitat structure and the fish assemblages.

2021

Publications scientifiques et ouvrages

All shallow coastal habitats matter as nurseries for Mediterranean juvenile fish

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Coastal zones are ecosystems of high economic value but exposed to numerous disturbances, while they represent nurseries for many fish species, raising the issue of the preservation of their functions and services. In this context, the juvenile fish assemblages of all types of habitats present in shallow coastal zones were studied on the south-east coast of France using underwater visual censuses in warm (June–July 2014) and cold (April 2015) periods. A total of fourteen habitat types were characterized, which could be grouped into three broad categories, rocky substrates (natural and artificial), sedimentary bottoms with all levels of granulometry, and seagrass beds including Cymodocea nodosa and Posidonia oceanica meadows; the ecotones or interfaces between the three broad habitat categories were individualized as particular habitat types.

2021

Publications scientifiques et ouvrages

3D photogrammetry modeling highlights efficient reserve effect apparition after 5 years and stillness after 40 for red coral (Corallium rubrum) conservation in French MPAs

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Imaging the marine environment is more and more useful to understand relationships between species, as well as natural processes. Developing photogrammetry allowed the use of 3D measuring to study populations dynamics of sessile organisms at various scales: from colony to population. This study focuses on red coral (Corallium rubrum), as known as precious coral. Metrics measured at a colony scale (e.g., maximum height, diameter and number of branches) allowed population understanding and a comparison between an old (Cerbère-Banyuls reserve) vs. a new (Calanques National Park) MPA.

2021

Mémoires de stage et thèse

Étude de la survie de transplants de Corallium rubrum et de Paramuricea clavata dans le cadre d’un programme expérimental de transplantation sur sites naturels (projet TRANSCOR)

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Dans le contexte de changement global actuel, les organismes marins sessiles sont parmi les plus impactés. Les épisodes d’anomalies thermiques de plus en plus fréquents sont particulièrement mortels pour Corallium rubrum et Paramuricea clavata. Dans une optique de conservation, la compréhension du cycle de vie de ces espèces est un sujet de recherche prépondérant. L’estimation de la croissance de ces espèces et leur réaction à la transplantation ont plusieurs fois été réalisées à partir de différentes méthodes. Ici, il a été montré que la transplantation de C. rubrum et P. clavata à l’aide de mastic époxy bi-composant offre des résultats convenables en termes de survie des transplants et que la photogrammétrie permet de mesurer avec robustesse les descripteurs de populations de ces espèces.

2021

Parutions presse et média

Une immersion dans les fonds marins marseillais pour le Congrès mondial de la nature

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Grottes, récifs artificiels, canyons sous-marins… Les «plongées virtuelles marseillaises » seront présentées par la Ville de Marseille, le Parc des Calanques et Septentrion Environnement durant le Congrès mondial de la nature. Une installation alliant visites immersives et jeux afin d’initier les visiteurs aux sciences participatives et à la protection des milieux marins.

2021

Rapports techniques et scientifiques

POLARIS – Note méthodologique

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Cette note méthodologique s’adresse principalement aux décideurs et gestionnaires d’espaces marins méditerranéens pour lesquels la plongée sous-marine constitue un outil de suivi du milieu par le biais des sciences participatives (protocoles d’observation standardisés, formation des observateurs, traitement et utilisation des données). Elle pourra être également utile à toute institution s’intéressant à l’utilisation de plateformes d’observation telles que POLARIS pour alimenter des stratégies de gestion de territoire à différentes échelles d’action. Enfin, cette note guidera les structures souhaitant utiliser les sciences participatives en plongée sous-marine en détaillant différents aspects scientifiques et techniques (protocoles de suivis, logistique, traitement et transfert des données, animation, formation, etc.).

2021

Parutions presse et média

Thalassa – Un musée sous la mer à Marseille

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A Marseille, à la Plage des Catalans, une dizaine de sculptures ont été immergé à quelques mètres de profondeur. Accessibles à tous en palme-masque-tuba, ces statues vont servir de substrat vierge sur lequel des organismes marins, végétaux et animaux, pourront se développer. A travers le projet Twinning-3D, les élèves du Lycée des Calanques vont suivre l’évolution de cette colonisation dans le temps grâce aux techniques de la photogrammétrie.

2021

Publications scientifiques et ouvrages

Population collapse of habitat-forming species in the Mediterranean: a long-term study of gorgonian populations affected by recurrent marine heatwaves

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En mer Méditerranée, les récifs rocheux peu profonds et la structure tridimensionnelle (3D) associée soutiennent des communautés riches et abondantes ; ils ont donc une importance fonctionnelle, notamment pour le renouvellement des stocks halieutiques. Cependant, ces habitats et leurs fonctions sont susceptibles d’être altérés par des pressions anthropiques induisant des transformations d’habitats. Il est donc nécessaire d’évaluer leur structure 3D, leurs transformations et leurs relations avec les communautés, notamment à des fins de gestion et de conservation. Dans cet article nous avons cherché (i) à comparer deux méthodes qui quantifient les métriques de la structure 3D (rugosité) des récifs rocheux peu profonds (méthode chain-and-tape et photogrammétrie), et (ii) à quantifier les liens possibles entre la structure de l’habitat et les assemblages de poissons.

2020

Rapports techniques et scientifiques

Présentation de résultats issus de données collectées à travers la plateforme de sciences participatives POLARIS dans le cadre du programme de recherche CIGESMED

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Le programme de science participative CIGESMED for divers est dédié à l’observation des habitats coralligènes. Les plongeurs volontaires ont contribué à collecter 89 observations au sein du Parc national des Calanques au cours d’une période de trois ans (2016-2018). Avec les données collectées, nous avons pu caractériser les récifs coralligènes et observer la distribution des organismes et des pressions qui les menacent. Nous avons ainsi pu dresser l’état zéro, auquel faire référence pour le suivi toujours en cours par les plongeurs de loisir. Nous choisissons ici d’exposer les résultats d’un point de vue de gestion puisque notre programme a notamment pour but d’aider à l’orientation de mesures en faveur de la gestion durable du milieu marin. Nous présenterons également des pistes pour de futures réflexions et analyses tirées des données collectées.

2020

Rapports techniques et scientifiques

POLARIS – Contribution aux programmes de recherche

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A l’interface des différentes activités, POLARIS est une plateforme de terrain pour observer le milieu marin, contribuer à la collecte de données venant compléter des actions scientifiques et sensibiliser des citoyens à une plongée environnementale. Ce catalogue rassemble les différentes méthodes d’observations (protocoles) rattachées à des programmes de recherche relayés par POLARIS.

2020

Rapports techniques et scientifiques

POLARIS – Veille environnementale

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A l’interface des différentes activités, POLARIS est une plateforme de terrain pour observer le milieu marin, contribuer à la collecte de données venant compléter des actions scientifiques et sensibiliser des citoyens à une plongée environnementale. La veille environnementale a pour but d’alerter sur des changements potentiels du milieu marin grâce à un suivi long terme pluriannuel. Il s’agit ici de surveiller la présence ou l’absence d’éléments renseignant sur l’état de santé du milieu ou pouvant y porter atteinte.

2020

Vidéos

TWINNING 3D – Apprendre la photogrammétrie #3 Le traitement des images

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Dernière de la série des 3 tutoriels dédiés à la photogrammétrie avec l’étape la plus stylée : le traitement des images et la création du modèle ! On a vu avant ce qu’était la photogrammétrie et comment faire les prises de vue pour réaliser un modèle 3D. Ici, on apprend à modéliser.

La vidéo est réalisée dans le cadre du projet TWINNING 3D porté par Septentrion Environnement et le Lycée des Calanques, initialement des cours prévus en salle mais finalement retranscris en vidéo à cause de la crise sanitaire liée à l’épidémie de la COVID-19.

2020

Vidéos

TWINNING 3D – apprendre la photogrammétrie #2 La prise de vue

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Dans ce deuxième tuto photogrammétrie, on s’attaque aux prises de vue : comment faire, quelles conditions de lumière idéale, etc.

La vidéo est réalisée dans le cadre du projet TWINNING 3D porté par Septentrion Environnement et le Lycée des Calanques, initialement des cours prévus en salle mais finalement retranscris en vidéo à cause de la crise sanitaire liée à l’épidémie de la COVID-19.

2020

Vidéos

TWINNING 3D – Apprendre la photogrammétrie #1 Les bases

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Dans cette vidéo, vous apprendrez les bases de la photogrammétrie : qu’est-ce donc que cette technique qui semble obscure, à quoi elle peut bien servir.

La vidéo est réalisée dans le cadre du projet TWINNING 3D porté par Septentrion Environnement et le Lycée des Calanques, initialement des cours prévus en salle mais finalement retranscris en vidéo à cause de la crise sanitaire liée à l’épidémie de la COVID-19.

2017

Publications scientifiques et ouvrages

Juvenile fish assemblages in temperate rocky reefs are shaped by the presence of macro-algae canopy and its three-dimensional structure.

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Arborescent macro-algae forests covering temperate rocky reefs are a known habitat for juvenile fishes. However, in the Mediterranean, these forests are undergoing severe transformations due to pressures from global change. In our study, juvenile fish assemblages differed between pristine arborescent forests (Cystoseira brachycarpa var. balearica) versus an alternate state: bushland (Dictyotales – Sphacelariales). Forests hosted richer and three-fold more abundant juvenile assemblages. This was consistent through space, whatever the local environmental conditions, along 40 km of NW Mediterranean subtidal rocky shores (Corsica, France).

2016

Mémoires de stage et thèse

Réalisation d’un projet pilote de plateforme d’observation de la mer et du littoral dans le contexte marseillais

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La protection de l’environnement marin fait l’objet d’une intégration grandissante dans les politiques publiques. Des programmes de recherche, coordonnés par des scientifiques, s’inscrivent dans des stratégies et des plans d’actions institutionnels multi-échelles en faveur de la biodiversité marine. Cependant, la temporalité des actions conduites par l’ensemble de ces acteurs n’est pas identique et rend l’utilisation des données de terrain parfois non optimisée. Pour tendre vers une gestion durable, les gestionnaires expriment un besoin de données dont le format soit homogène dans le temps et l’espace. D’un autre côté, les plongeurs loisirs révèlent un réel intérêt pour contribuer à la protection du milieu marin, via la collecte de données de terrain. POLARIS est un projet pilote qui se positionne comme une plateforme technique et pédagogique dédiée à l’acquisition de données de terrain en faveur de la connaissance et de la protection du milieu marin.

2014

Congrès et conférences

Characterizing Corallium rubrum populations of two Mediterranean MPAs using underwater photogrammetry.

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In the frame of two MPA management (the recently enforced Calanques National Park and the 30 years-old Banyuls MPA) Corallium rubrum (Cnidaria) populations were studied in order to give managers useful data for population management. Data on morphology, recruitment and population size-structure were collected in both MPAs using novel photogrammetric methods allowing precise tridimensional measures. We assessed size structures and population dynamics and linked it to the protection levels of both MPAs.

2013

Publications scientifiques et ouvrages

Effect of depth and canopy height on the nursery value of Cystoseira balearica forests for Mediterranean rocky reef fishes.

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We studied effects of depth and Cystoseira balearica forests canopy height on coastal juvenile fish assemblages of Minorca Island. Results showed a clear differentiation of juvenile fish assemblages due to depth: assemblage in the shallowest range (3-4m) was characterized by higher densities of Thalassoma pavo, deeper ones (6-8, 10-12 m) by higher densities of Coris julis. Smallest juveniles of both species were more abundant within forests displaying the highest canopy height; meanwhile largest juveniles were more abundant within low Cystoseira forests. Also, both species showed predominantly a cryptic behavior on forest of higher canopy height, and a temporal one when canopy was lower.